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SoftGene:蛋白语言模型增强的基因集注释框架

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AI 综述

Drew Ross 等作者提交论文预印本,提出基因集注释框架 SoftGene。该框架用基于 ESM 的层次化注意力编码器,把基因集表示为蛋白质氨基酸序列信息,再结合基因集嵌入生成的软提示与 LLM 生成的辅助上下文硬提示,输入本地 LLM 完成注释。作者称其利用基因集的层次结构实现基于 LLM 的可解释基因集注释。

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报道时间线

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10月5日
  1. arXiv:cs.AI
    SoftGene:蛋白质语言模型增强的软提示实现可解释基因集注释

    SoftGene 是一个基于 LLM 的基因集注释框架,用基于 ESM 的层次化注意力编码器将基因集表示为蛋白质氨基酸序列信息,再结合基因集嵌入生成的软提示与 LLM 生成的辅助上下文硬提示,输入本地 LLM 完成注释。

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